Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
H2-Ab1P01921 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
H2-Ab1P01921 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms