Protein–RNA interactions for Protein: P01901

H2-K1, H-2 class I histocompatibility antigen, K-B alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-K1P01901 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-K1P01901 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-K1P01901 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-K1P01901 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-K1P01901 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-K1P01901 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-K1P01901 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-K1P01901 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-K1P01901 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-K1P01901 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-K1P01901 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-K1P01901 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-K1P01901 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-K1P01901 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-K1P01901 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-K1P01901 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-K1P01901 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-K1P01901 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-K1P01901 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
H2-K1P01901 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-K1P01901 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-K1P01901 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-K1P01901 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-K1P01901 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-K1P01901 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-K1P01901 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-K1P01901 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-K1P01901 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-K1P01901 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-K1P01901 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-K1P01901 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-K1P01901 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-K1P01901 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-K1P01901 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-K1P01901 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-K1P01901 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-K1P01901 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-K1P01901 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
H2-K1P01901 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
H2-K1P01901 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
H2-K1P01901 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
H2-K1P01901 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
H2-K1P01901 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-K1P01901 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-K1P01901 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-K1P01901 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-K1P01901 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-K1P01901 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-K1P01901 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-K1P01901 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-K1P01901 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-K1P01901 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-K1P01901 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-K1P01901 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-K1P01901 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
H2-K1P01901 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-K1P01901 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-K1P01901 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-K1P01901 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-K1P01901 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-K1P01901 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-K1P01901 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-K1P01901 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-K1P01901 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-K1P01901 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-K1P01901 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-K1P01901 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-K1P01901 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-K1P01901 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-K1P01901 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-K1P01901 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-K1P01901 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-K1P01901 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-K1P01901 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-K1P01901 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
H2-K1P01901 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-K1P01901 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-K1P01901 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-K1P01901 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-K1P01901 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-K1P01901 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-K1P01901 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-K1P01901 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-K1P01901 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-K1P01901 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-K1P01901 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-K1P01901 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-K1P01901 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-K1P01901 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-K1P01901 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
H2-K1P01901 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-K1P01901 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-K1P01901 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-K1P01901 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-K1P01901 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-K1P01901 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-K1P01901 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-K1P01901 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-K1P01901 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
H2-K1P01901 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms