Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01649 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01649 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01649 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01649 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01649 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P01649 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01649 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01649 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01649 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01649 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01649 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01649 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01649 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
P01649 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01649 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01649 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01649 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01649 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01649 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01649 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01649 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01649 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01649 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01649 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01649 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01649 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01649 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01649 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01649 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01649 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01649 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01649 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01649 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01649 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01649 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01649 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01649 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01649 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01649 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01649 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01649 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01649 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01649 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01649 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01649 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01649 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01649 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01649 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01649 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01649 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01649 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01649 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01649 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01649 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01649 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01649 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01649 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01649 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P01649 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01649 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01649 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01649 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01649 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01649 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01649 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01649 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01649 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01649 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01649 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
P01649 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01649 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01649 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
P01649 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
P01649 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01649 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01649 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01649 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01649 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01649 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01649 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
P01649 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
P01649 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01649 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01649 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01649 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01649 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01649 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01649 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01649 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01649 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01649 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01649 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01649 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01649 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01649 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01649 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01649 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01649 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
P01649 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms