Protein–RNA interactions for Protein: P01637

Ig kappa chain V-V region T1, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01637 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01637 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01637 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01637 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01637 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
P01637 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01637 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
P01637 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01637 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01637 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01637 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01637 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01637 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01637 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01637 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
P01637 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
P01637 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
P01637 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
P01637 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01637 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01637 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01637 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01637 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01637 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01637 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01637 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
P01637 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01637 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01637 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01637 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01637 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01637 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01637 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
P01637 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01637 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01637 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01637 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01637 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01637 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01637 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01637 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01637 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01637 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01637 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01637 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01637 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01637 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
P01637 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01637 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
P01637 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
P01637 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01637 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01637 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01637 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01637 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01637 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
P01637 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01637 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01637 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01637 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01637 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01637 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01637 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01637 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01637 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01637 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01637 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01637 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01637 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01637 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01637 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01637 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01637 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
P01637 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01637 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01637 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P01637 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01637 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01637 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01637 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01637 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
P01637 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01637 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01637 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01637 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
P01637 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
P01637 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01637 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01637 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01637 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01637 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01637 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01637 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01637 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01637 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01637 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01637 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01637 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01637 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P01637 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms