Protein–RNA interactions for Protein: O89104

Sypl2, Synaptophysin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sypl2O89104 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Sypl2O89104 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sypl2O89104 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sypl2O89104 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sypl2O89104 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sypl2O89104 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sypl2O89104 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sypl2O89104 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sypl2O89104 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Sypl2O89104 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sypl2O89104 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sypl2O89104 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sypl2O89104 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Sypl2O89104 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sypl2O89104 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sypl2O89104 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sypl2O89104 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sypl2O89104 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sypl2O89104 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Sypl2O89104 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Sypl2O89104 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sypl2O89104 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sypl2O89104 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sypl2O89104 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sypl2O89104 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sypl2O89104 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sypl2O89104 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Sypl2O89104 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sypl2O89104 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Sypl2O89104 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sypl2O89104 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sypl2O89104 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sypl2O89104 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Sypl2O89104 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sypl2O89104 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sypl2O89104 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sypl2O89104 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sypl2O89104 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sypl2O89104 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Sypl2O89104 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sypl2O89104 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sypl2O89104 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sypl2O89104 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sypl2O89104 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sypl2O89104 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Sypl2O89104 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Sypl2O89104 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sypl2O89104 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sypl2O89104 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Sypl2O89104 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sypl2O89104 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sypl2O89104 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sypl2O89104 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sypl2O89104 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Sypl2O89104 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sypl2O89104 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sypl2O89104 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Sypl2O89104 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Sypl2O89104 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sypl2O89104 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sypl2O89104 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sypl2O89104 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sypl2O89104 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sypl2O89104 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sypl2O89104 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sypl2O89104 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sypl2O89104 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sypl2O89104 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sypl2O89104 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sypl2O89104 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sypl2O89104 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Sypl2O89104 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sypl2O89104 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sypl2O89104 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sypl2O89104 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sypl2O89104 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sypl2O89104 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sypl2O89104 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sypl2O89104 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sypl2O89104 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sypl2O89104 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sypl2O89104 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Sypl2O89104 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sypl2O89104 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sypl2O89104 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sypl2O89104 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sypl2O89104 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sypl2O89104 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sypl2O89104 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Sypl2O89104 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Sypl2O89104 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sypl2O89104 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sypl2O89104 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sypl2O89104 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sypl2O89104 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sypl2O89104 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sypl2O89104 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sypl2O89104 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Sypl2O89104 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Sypl2O89104 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms