Protein–RNA interactions for Protein: O88951

Lin7b, Protein lin-7 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin7bO88951 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Lin7bO88951 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lin7bO88951 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Lin7bO88951 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lin7bO88951 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lin7bO88951 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Lin7bO88951 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lin7bO88951 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lin7bO88951 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lin7bO88951 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lin7bO88951 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lin7bO88951 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lin7bO88951 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lin7bO88951 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lin7bO88951 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lin7bO88951 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lin7bO88951 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lin7bO88951 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Lin7bO88951 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin7bO88951 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin7bO88951 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin7bO88951 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin7bO88951 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin7bO88951 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin7bO88951 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin7bO88951 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin7bO88951 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin7bO88951 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin7bO88951 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin7bO88951 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin7bO88951 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin7bO88951 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin7bO88951 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin7bO88951 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin7bO88951 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin7bO88951 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin7bO88951 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin7bO88951 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin7bO88951 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin7bO88951 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin7bO88951 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin7bO88951 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin7bO88951 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin7bO88951 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin7bO88951 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin7bO88951 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin7bO88951 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin7bO88951 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Lin7bO88951 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin7bO88951 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin7bO88951 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Lin7bO88951 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms