Protein–RNA interactions for Protein: O88940

Msc, Musculin, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MscO88940 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MscO88940 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MscO88940 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MscO88940 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MscO88940 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MscO88940 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
MscO88940 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MscO88940 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MscO88940 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MscO88940 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MscO88940 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MscO88940 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MscO88940 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MscO88940 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MscO88940 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MscO88940 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
MscO88940 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MscO88940 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
MscO88940 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MscO88940 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MscO88940 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MscO88940 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MscO88940 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MscO88940 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MscO88940 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
MscO88940 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MscO88940 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MscO88940 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MscO88940 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
MscO88940 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
MscO88940 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MscO88940 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MscO88940 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MscO88940 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MscO88940 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MscO88940 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MscO88940 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MscO88940 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MscO88940 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MscO88940 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
MscO88940 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MscO88940 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MscO88940 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MscO88940 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MscO88940 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MscO88940 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
MscO88940 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
MscO88940 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
MscO88940 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
MscO88940 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MscO88940 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MscO88940 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MscO88940 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MscO88940 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MscO88940 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MscO88940 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MscO88940 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MscO88940 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MscO88940 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MscO88940 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MscO88940 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
MscO88940 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
MscO88940 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MscO88940 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MscO88940 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MscO88940 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MscO88940 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MscO88940 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MscO88940 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MscO88940 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MscO88940 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MscO88940 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MscO88940 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MscO88940 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
MscO88940 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MscO88940 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MscO88940 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MscO88940 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MscO88940 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MscO88940 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MscO88940 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
MscO88940 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
MscO88940 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MscO88940 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MscO88940 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MscO88940 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MscO88940 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MscO88940 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MscO88940 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MscO88940 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MscO88940 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MscO88940 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MscO88940 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MscO88940 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MscO88940 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MscO88940 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MscO88940 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
MscO88940 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MscO88940 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
MscO88940 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms