Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CcnkO88874 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CcnkO88874 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CcnkO88874 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CcnkO88874 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CcnkO88874 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CcnkO88874 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CcnkO88874 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CcnkO88874 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CcnkO88874 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CcnkO88874 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CcnkO88874 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CcnkO88874 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CcnkO88874 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CcnkO88874 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CcnkO88874 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CcnkO88874 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms