Protein–RNA interactions for Protein: O88824

Jtb, Protein JTB, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JtbO88824 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JtbO88824 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
JtbO88824 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JtbO88824 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
JtbO88824 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JtbO88824 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JtbO88824 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JtbO88824 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JtbO88824 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JtbO88824 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
JtbO88824 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JtbO88824 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
JtbO88824 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JtbO88824 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JtbO88824 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JtbO88824 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
JtbO88824 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
JtbO88824 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
JtbO88824 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JtbO88824 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
JtbO88824 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
JtbO88824 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
JtbO88824 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JtbO88824 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JtbO88824 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JtbO88824 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
JtbO88824 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JtbO88824 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JtbO88824 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
JtbO88824 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JtbO88824 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
JtbO88824 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
JtbO88824 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
JtbO88824 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
JtbO88824 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
JtbO88824 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
JtbO88824 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
JtbO88824 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
JtbO88824 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
JtbO88824 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
JtbO88824 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
JtbO88824 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
JtbO88824 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
JtbO88824 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
JtbO88824 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
JtbO88824 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
JtbO88824 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
JtbO88824 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
JtbO88824 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
JtbO88824 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
JtbO88824 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
JtbO88824 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
JtbO88824 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
JtbO88824 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
JtbO88824 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
JtbO88824 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
JtbO88824 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
JtbO88824 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
JtbO88824 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
JtbO88824 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
JtbO88824 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
JtbO88824 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
JtbO88824 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
JtbO88824 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
JtbO88824 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
JtbO88824 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
JtbO88824 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
JtbO88824 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
JtbO88824 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
JtbO88824 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
JtbO88824 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
JtbO88824 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
JtbO88824 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
JtbO88824 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
JtbO88824 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
JtbO88824 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
JtbO88824 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
JtbO88824 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
JtbO88824 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
JtbO88824 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
JtbO88824 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
JtbO88824 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
JtbO88824 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
JtbO88824 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
JtbO88824 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
JtbO88824 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
JtbO88824 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
JtbO88824 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
JtbO88824 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
JtbO88824 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
JtbO88824 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
JtbO88824 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
JtbO88824 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
JtbO88824 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
JtbO88824 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
JtbO88824 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
JtbO88824 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
JtbO88824 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
JtbO88824 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
JtbO88824 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms