Protein–RNA interactions for Protein: O88665

Brd7, Bromodomain-containing protein 7, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd7O88665 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brd7O88665 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Brd7O88665 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brd7O88665 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brd7O88665 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brd7O88665 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Brd7O88665 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms