Protein–RNA interactions for Protein: O88609

Lmx1b, LIM homeobox transcription factor 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmx1bO88609 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lmx1bO88609 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lmx1bO88609 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms