Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Cops6O88545 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cops6O88545 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cops6O88545 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cops6O88545 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cops6O88545 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cops6O88545 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cops6O88545 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cops6O88545 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cops6O88545 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cops6O88545 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cops6O88545 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cops6O88545 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cops6O88545 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cops6O88545 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cops6O88545 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cops6O88545 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cops6O88545 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cops6O88545 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cops6O88545 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cops6O88545 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cops6O88545 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cops6O88545 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cops6O88545 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cops6O88545 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cops6O88545 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cops6O88545 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cops6O88545 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cops6O88545 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cops6O88545 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cops6O88545 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cops6O88545 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cops6O88545 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cops6O88545 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cops6O88545 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cops6O88545 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cops6O88545 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cops6O88545 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cops6O88545 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cops6O88545 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Cops6O88545 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cops6O88545 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cops6O88545 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cops6O88545 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cops6O88545 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cops6O88545 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cops6O88545 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Cops6O88545 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cops6O88545 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cops6O88545 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cops6O88545 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cops6O88545 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cops6O88545 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cops6O88545 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cops6O88545 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cops6O88545 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cops6O88545 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cops6O88545 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cops6O88545 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cops6O88545 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cops6O88545 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cops6O88545 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cops6O88545 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cops6O88545 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cops6O88545 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cops6O88545 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cops6O88545 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cops6O88545 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cops6O88545 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cops6O88545 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Cops6O88545 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cops6O88545 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Cops6O88545 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cops6O88545 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cops6O88545 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cops6O88545 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cops6O88545 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cops6O88545 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cops6O88545 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cops6O88545 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cops6O88545 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cops6O88545 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cops6O88545 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cops6O88545 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cops6O88545 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cops6O88545 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cops6O88545 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cops6O88545 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cops6O88545 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cops6O88545 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cops6O88545 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cops6O88545 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cops6O88545 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cops6O88545 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cops6O88545 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cops6O88545 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cops6O88545 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cops6O88545 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cops6O88545 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cops6O88545 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
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