Protein–RNA interactions for Protein: O88544

Cops4, COP9 signalosome complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops4O88544 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cops4O88544 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cops4O88544 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cops4O88544 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cops4O88544 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cops4O88544 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cops4O88544 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cops4O88544 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cops4O88544 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cops4O88544 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cops4O88544 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cops4O88544 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cops4O88544 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cops4O88544 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cops4O88544 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cops4O88544 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cops4O88544 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cops4O88544 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cops4O88544 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cops4O88544 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cops4O88544 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cops4O88544 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cops4O88544 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cops4O88544 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cops4O88544 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cops4O88544 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cops4O88544 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cops4O88544 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cops4O88544 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cops4O88544 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cops4O88544 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cops4O88544 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cops4O88544 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cops4O88544 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cops4O88544 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cops4O88544 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cops4O88544 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cops4O88544 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cops4O88544 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cops4O88544 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cops4O88544 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cops4O88544 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cops4O88544 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cops4O88544 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cops4O88544 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cops4O88544 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cops4O88544 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cops4O88544 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cops4O88544 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cops4O88544 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cops4O88544 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cops4O88544 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cops4O88544 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cops4O88544 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cops4O88544 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cops4O88544 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cops4O88544 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cops4O88544 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cops4O88544 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cops4O88544 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cops4O88544 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cops4O88544 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cops4O88544 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cops4O88544 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cops4O88544 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cops4O88544 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cops4O88544 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cops4O88544 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cops4O88544 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cops4O88544 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cops4O88544 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cops4O88544 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cops4O88544 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cops4O88544 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cops4O88544 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cops4O88544 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cops4O88544 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cops4O88544 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cops4O88544 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cops4O88544 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cops4O88544 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cops4O88544 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cops4O88544 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cops4O88544 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cops4O88544 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cops4O88544 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cops4O88544 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cops4O88544 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cops4O88544 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cops4O88544 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cops4O88544 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cops4O88544 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cops4O88544 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cops4O88544 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cops4O88544 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cops4O88544 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cops4O88544 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cops4O88544 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cops4O88544 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cops4O88544 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms