Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dnmt3bO88509 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Dnmt3bO88509 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms