Protein–RNA interactions for Protein: O88508

Dnmt3a, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3aO88508 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnmt3aO88508 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnmt3aO88508 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnmt3aO88508 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnmt3aO88508 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnmt3aO88508 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnmt3aO88508 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnmt3aO88508 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnmt3aO88508 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnmt3aO88508 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnmt3aO88508 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnmt3aO88508 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnmt3aO88508 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnmt3aO88508 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnmt3aO88508 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Dnmt3aO88508 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnmt3aO88508 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnmt3aO88508 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnmt3aO88508 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnmt3aO88508 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnmt3aO88508 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnmt3aO88508 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnmt3aO88508 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnmt3aO88508 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnmt3aO88508 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnmt3aO88508 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnmt3aO88508 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Dnmt3aO88508 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnmt3aO88508 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnmt3aO88508 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnmt3aO88508 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnmt3aO88508 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnmt3aO88508 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnmt3aO88508 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnmt3aO88508 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnmt3aO88508 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnmt3aO88508 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnmt3aO88508 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnmt3aO88508 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnmt3aO88508 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnmt3aO88508 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnmt3aO88508 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnmt3aO88508 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnmt3aO88508 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnmt3aO88508 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Dnmt3aO88508 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnmt3aO88508 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnmt3aO88508 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnmt3aO88508 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnmt3aO88508 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnmt3aO88508 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnmt3aO88508 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnmt3aO88508 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnmt3aO88508 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Dnmt3aO88508 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnmt3aO88508 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnmt3aO88508 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnmt3aO88508 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnmt3aO88508 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnmt3aO88508 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnmt3aO88508 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnmt3aO88508 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnmt3aO88508 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnmt3aO88508 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnmt3aO88508 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnmt3aO88508 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnmt3aO88508 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnmt3aO88508 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnmt3aO88508 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnmt3aO88508 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnmt3aO88508 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnmt3aO88508 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Dnmt3aO88508 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Dnmt3aO88508 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms