Protein–RNA interactions for Protein: O88456

Capns1, Calpain small subunit 1, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns1O88456 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capns1O88456 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Capns1O88456 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capns1O88456 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capns1O88456 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capns1O88456 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capns1O88456 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capns1O88456 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capns1O88456 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capns1O88456 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Capns1O88456 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Capns1O88456 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Capns1O88456 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Capns1O88456 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Capns1O88456 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Capns1O88456 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Capns1O88456 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Capns1O88456 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Capns1O88456 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Capns1O88456 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Capns1O88456 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Capns1O88456 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Capns1O88456 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Capns1O88456 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Capns1O88456 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Capns1O88456 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Capns1O88456 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capns1O88456 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capns1O88456 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capns1O88456 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capns1O88456 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capns1O88456 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capns1O88456 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capns1O88456 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capns1O88456 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capns1O88456 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capns1O88456 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capns1O88456 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capns1O88456 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capns1O88456 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capns1O88456 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capns1O88456 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Capns1O88456 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capns1O88456 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capns1O88456 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capns1O88456 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capns1O88456 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capns1O88456 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capns1O88456 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capns1O88456 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capns1O88456 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capns1O88456 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capns1O88456 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capns1O88456 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capns1O88456 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Capns1O88456 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capns1O88456 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capns1O88456 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capns1O88456 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capns1O88456 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capns1O88456 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capns1O88456 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capns1O88456 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capns1O88456 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Capns1O88456 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capns1O88456 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capns1O88456 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capns1O88456 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capns1O88456 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capns1O88456 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capns1O88456 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capns1O88456 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Capns1O88456 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capns1O88456 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capns1O88456 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capns1O88456 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capns1O88456 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capns1O88456 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Capns1O88456 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capns1O88456 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capns1O88456 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capns1O88456 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capns1O88456 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capns1O88456 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capns1O88456 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Capns1O88456 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capns1O88456 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Capns1O88456 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capns1O88456 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Capns1O88456 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capns1O88456 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capns1O88456 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capns1O88456 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capns1O88456 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capns1O88456 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capns1O88456 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capns1O88456 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capns1O88456 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capns1O88456 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Capns1O88456 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms