Protein–RNA interactions for Protein: O88425

Nme6, Nucleoside diphosphate kinase 6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme6O88425 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Nme6O88425 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme6O88425 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme6O88425 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme6O88425 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme6O88425 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme6O88425 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme6O88425 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme6O88425 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme6O88425 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme6O88425 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme6O88425 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme6O88425 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme6O88425 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme6O88425 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme6O88425 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme6O88425 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme6O88425 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme6O88425 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme6O88425 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme6O88425 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme6O88425 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme6O88425 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme6O88425 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme6O88425 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme6O88425 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Nme6O88425 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nme6O88425 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nme6O88425 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nme6O88425 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nme6O88425 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nme6O88425 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nme6O88425 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Nme6O88425 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nme6O88425 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nme6O88425 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nme6O88425 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nme6O88425 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nme6O88425 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nme6O88425 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nme6O88425 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nme6O88425 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nme6O88425 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nme6O88425 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nme6O88425 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nme6O88425 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nme6O88425 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nme6O88425 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nme6O88425 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nme6O88425 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nme6O88425 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nme6O88425 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nme6O88425 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nme6O88425 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nme6O88425 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nme6O88425 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nme6O88425 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme6O88425 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme6O88425 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme6O88425 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme6O88425 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme6O88425 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme6O88425 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme6O88425 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme6O88425 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme6O88425 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme6O88425 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme6O88425 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme6O88425 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme6O88425 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nme6O88425 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nme6O88425 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nme6O88425 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nme6O88425 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nme6O88425 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nme6O88425 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nme6O88425 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Nme6O88425 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nme6O88425 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nme6O88425 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nme6O88425 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nme6O88425 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nme6O88425 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nme6O88425 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nme6O88425 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nme6O88425 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nme6O88425 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nme6O88425 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nme6O88425 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nme6O88425 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nme6O88425 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nme6O88425 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nme6O88425 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Nme6O88425 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nme6O88425 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nme6O88425 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nme6O88425 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nme6O88425 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Nme6O88425 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nme6O88425 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms