Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CtssO70370 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CtssO70370 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CtssO70370 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CtssO70370 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CtssO70370 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CtssO70370 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CtssO70370 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CtssO70370 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CtssO70370 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CtssO70370 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CtssO70370 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CtssO70370 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CtssO70370 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CtssO70370 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CtssO70370 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CtssO70370 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CtssO70370 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CtssO70370 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CtssO70370 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CtssO70370 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CtssO70370 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CtssO70370 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CtssO70370 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CtssO70370 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CtssO70370 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CtssO70370 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CtssO70370 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CtssO70370 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CtssO70370 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CtssO70370 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CtssO70370 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CtssO70370 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CtssO70370 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CtssO70370 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CtssO70370 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CtssO70370 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CtssO70370 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CtssO70370 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CtssO70370 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CtssO70370 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CtssO70370 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CtssO70370 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CtssO70370 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CtssO70370 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CtssO70370 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CtssO70370 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CtssO70370 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CtssO70370 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CtssO70370 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CtssO70370 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CtssO70370 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CtssO70370 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CtssO70370 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CtssO70370 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CtssO70370 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CtssO70370 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CtssO70370 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CtssO70370 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CtssO70370 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CtssO70370 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CtssO70370 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CtssO70370 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CtssO70370 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CtssO70370 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CtssO70370 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CtssO70370 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CtssO70370 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CtssO70370 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CtssO70370 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CtssO70370 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CtssO70370 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CtssO70370 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CtssO70370 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CtssO70370 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CtssO70370 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CtssO70370 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CtssO70370 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CtssO70370 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CtssO70370 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CtssO70370 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CtssO70370 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CtssO70370 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CtssO70370 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CtssO70370 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CtssO70370 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CtssO70370 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CtssO70370 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CtssO70370 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CtssO70370 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CtssO70370 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CtssO70370 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CtssO70370 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CtssO70370 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CtssO70370 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CtssO70370 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CtssO70370 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CtssO70370 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CtssO70370 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CtssO70370 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms