Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

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Length 728 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lnx1O70263 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lnx1O70263 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Lnx1O70263 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lnx1O70263 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lnx1O70263 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lnx1O70263 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Lnx1O70263 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lnx1O70263 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lnx1O70263 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lnx1O70263 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Lnx1O70263 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lnx1O70263 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lnx1O70263 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lnx1O70263 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lnx1O70263 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lnx1O70263 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Lnx1O70263 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lnx1O70263 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lnx1O70263 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lnx1O70263 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lnx1O70263 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lnx1O70263 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lnx1O70263 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lnx1O70263 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lnx1O70263 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lnx1O70263 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lnx1O70263 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lnx1O70263 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Lnx1O70263 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lnx1O70263 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lnx1O70263 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lnx1O70263 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lnx1O70263 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lnx1O70263 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lnx1O70263 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lnx1O70263 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Lnx1O70263 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Lnx1O70263 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lnx1O70263 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lnx1O70263 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lnx1O70263 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lnx1O70263 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lnx1O70263 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lnx1O70263 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lnx1O70263 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Lnx1O70263 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lnx1O70263 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lnx1O70263 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Lnx1O70263 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lnx1O70263 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lnx1O70263 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lnx1O70263 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lnx1O70263 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lnx1O70263 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Lnx1O70263 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lnx1O70263 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lnx1O70263 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lnx1O70263 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lnx1O70263 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lnx1O70263 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lnx1O70263 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lnx1O70263 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lnx1O70263 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lnx1O70263 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lnx1O70263 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Lnx1O70263 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lnx1O70263 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lnx1O70263 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lnx1O70263 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lnx1O70263 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lnx1O70263 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lnx1O70263 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Lnx1O70263 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lnx1O70263 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lnx1O70263 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lnx1O70263 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Lnx1O70263 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lnx1O70263 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Lnx1O70263 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Lnx1O70263 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lnx1O70263 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lnx1O70263 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lnx1O70263 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lnx1O70263 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lnx1O70263 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lnx1O70263 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Lnx1O70263 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lnx1O70263 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lnx1O70263 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lnx1O70263 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lnx1O70263 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lnx1O70263 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Lnx1O70263 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lnx1O70263 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lnx1O70263 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lnx1O70263 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lnx1O70263 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lnx1O70263 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Lnx1O70263 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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