Protein–RNA interactions for Protein: O70174

Chrna4, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna4O70174 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chrna4O70174 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chrna4O70174 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chrna4O70174 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chrna4O70174 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chrna4O70174 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chrna4O70174 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chrna4O70174 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chrna4O70174 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Chrna4O70174 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chrna4O70174 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chrna4O70174 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chrna4O70174 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chrna4O70174 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chrna4O70174 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chrna4O70174 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chrna4O70174 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chrna4O70174 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chrna4O70174 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chrna4O70174 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chrna4O70174 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Chrna4O70174 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chrna4O70174 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chrna4O70174 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chrna4O70174 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chrna4O70174 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chrna4O70174 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chrna4O70174 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chrna4O70174 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chrna4O70174 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chrna4O70174 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chrna4O70174 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chrna4O70174 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chrna4O70174 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chrna4O70174 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chrna4O70174 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chrna4O70174 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chrna4O70174 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chrna4O70174 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chrna4O70174 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Chrna4O70174 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Chrna4O70174 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Chrna4O70174 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Chrna4O70174 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Chrna4O70174 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms