Protein–RNA interactions for Protein: O70137

Alx3, Homeobox protein aristaless-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alx3O70137 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Alx3O70137 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Alx3O70137 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Alx3O70137 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Alx3O70137 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Alx3O70137 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Alx3O70137 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Alx3O70137 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Alx3O70137 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Alx3O70137 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Alx3O70137 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Alx3O70137 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Alx3O70137 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Alx3O70137 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Alx3O70137 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Alx3O70137 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Alx3O70137 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Alx3O70137 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Alx3O70137 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Alx3O70137 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Alx3O70137 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Alx3O70137 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Alx3O70137 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Alx3O70137 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Alx3O70137 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alx3O70137 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alx3O70137 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alx3O70137 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alx3O70137 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alx3O70137 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alx3O70137 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alx3O70137 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Alx3O70137 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alx3O70137 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alx3O70137 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alx3O70137 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alx3O70137 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alx3O70137 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alx3O70137 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alx3O70137 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alx3O70137 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alx3O70137 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alx3O70137 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alx3O70137 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alx3O70137 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alx3O70137 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alx3O70137 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alx3O70137 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alx3O70137 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Alx3O70137 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alx3O70137 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alx3O70137 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alx3O70137 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alx3O70137 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alx3O70137 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alx3O70137 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alx3O70137 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alx3O70137 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alx3O70137 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Alx3O70137 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alx3O70137 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alx3O70137 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alx3O70137 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alx3O70137 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alx3O70137 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alx3O70137 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alx3O70137 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alx3O70137 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alx3O70137 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alx3O70137 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alx3O70137 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alx3O70137 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alx3O70137 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alx3O70137 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alx3O70137 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Alx3O70137 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Alx3O70137 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Alx3O70137 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Alx3O70137 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Alx3O70137 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Alx3O70137 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Alx3O70137 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Alx3O70137 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Alx3O70137 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Alx3O70137 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Alx3O70137 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Alx3O70137 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Alx3O70137 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Alx3O70137 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Alx3O70137 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Alx3O70137 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Alx3O70137 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Alx3O70137 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Alx3O70137 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Alx3O70137 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Alx3O70137 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Alx3O70137 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Alx3O70137 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Alx3O70137 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Alx3O70137 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms