Protein–RNA interactions for Protein: O55236

Rngtt, mRNA-capping enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RngttO55236 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RngttO55236 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RngttO55236 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RngttO55236 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RngttO55236 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
RngttO55236 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RngttO55236 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RngttO55236 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RngttO55236 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RngttO55236 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RngttO55236 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RngttO55236 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RngttO55236 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RngttO55236 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RngttO55236 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RngttO55236 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RngttO55236 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RngttO55236 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RngttO55236 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RngttO55236 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RngttO55236 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RngttO55236 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RngttO55236 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RngttO55236 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RngttO55236 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RngttO55236 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RngttO55236 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RngttO55236 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RngttO55236 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RngttO55236 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
RngttO55236 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RngttO55236 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RngttO55236 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RngttO55236 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RngttO55236 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RngttO55236 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RngttO55236 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RngttO55236 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RngttO55236 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RngttO55236 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RngttO55236 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RngttO55236 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RngttO55236 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
RngttO55236 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RngttO55236 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RngttO55236 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RngttO55236 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RngttO55236 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
RngttO55236 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
RngttO55236 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
RngttO55236 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
RngttO55236 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
RngttO55236 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RngttO55236 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RngttO55236 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RngttO55236 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RngttO55236 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RngttO55236 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RngttO55236 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RngttO55236 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RngttO55236 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RngttO55236 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RngttO55236 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RngttO55236 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RngttO55236 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RngttO55236 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RngttO55236 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RngttO55236 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RngttO55236 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RngttO55236 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RngttO55236 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
RngttO55236 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RngttO55236 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RngttO55236 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RngttO55236 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RngttO55236 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RngttO55236 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RngttO55236 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RngttO55236 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RngttO55236 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RngttO55236 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RngttO55236 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RngttO55236 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RngttO55236 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RngttO55236 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RngttO55236 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RngttO55236 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RngttO55236 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RngttO55236 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RngttO55236 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RngttO55236 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RngttO55236 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RngttO55236 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RngttO55236 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RngttO55236 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RngttO55236 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RngttO55236 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RngttO55236 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RngttO55236 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
RngttO55236 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms