Protein–RNA interactions for Protein: O55208

Figla, Factor in the germline alpha, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FiglaO55208 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FiglaO55208 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FiglaO55208 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FiglaO55208 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FiglaO55208 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FiglaO55208 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FiglaO55208 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
FiglaO55208 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
FiglaO55208 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FiglaO55208 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FiglaO55208 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FiglaO55208 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FiglaO55208 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FiglaO55208 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FiglaO55208 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
FiglaO55208 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FiglaO55208 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FiglaO55208 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FiglaO55208 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FiglaO55208 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FiglaO55208 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
FiglaO55208 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FiglaO55208 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FiglaO55208 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
FiglaO55208 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FiglaO55208 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FiglaO55208 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FiglaO55208 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FiglaO55208 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FiglaO55208 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FiglaO55208 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FiglaO55208 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FiglaO55208 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FiglaO55208 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FiglaO55208 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FiglaO55208 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FiglaO55208 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FiglaO55208 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FiglaO55208 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
FiglaO55208 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
FiglaO55208 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FiglaO55208 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FiglaO55208 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FiglaO55208 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FiglaO55208 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FiglaO55208 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FiglaO55208 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
FiglaO55208 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FiglaO55208 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FiglaO55208 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FiglaO55208 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FiglaO55208 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FiglaO55208 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FiglaO55208 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FiglaO55208 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
FiglaO55208 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
FiglaO55208 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FiglaO55208 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FiglaO55208 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FiglaO55208 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FiglaO55208 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FiglaO55208 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FiglaO55208 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FiglaO55208 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FiglaO55208 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FiglaO55208 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FiglaO55208 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FiglaO55208 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FiglaO55208 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FiglaO55208 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
FiglaO55208 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FiglaO55208 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FiglaO55208 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
FiglaO55208 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
FiglaO55208 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FiglaO55208 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
FiglaO55208 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FiglaO55208 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FiglaO55208 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FiglaO55208 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FiglaO55208 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FiglaO55208 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FiglaO55208 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FiglaO55208 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FiglaO55208 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FiglaO55208 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FiglaO55208 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FiglaO55208 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FiglaO55208 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
FiglaO55208 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
FiglaO55208 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FiglaO55208 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FiglaO55208 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FiglaO55208 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FiglaO55208 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FiglaO55208 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FiglaO55208 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FiglaO55208 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FiglaO55208 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
FiglaO55208 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms