Protein–RNA interactions for Protein: O55127

Cyp26a1, Cytochrome P450 26A1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp26a1O55127 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Cyp26a1O55127 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cyp26a1O55127 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cyp26a1O55127 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cyp26a1O55127 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cyp26a1O55127 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Cyp26a1O55127 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cyp26a1O55127 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cyp26a1O55127 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cyp26a1O55127 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cyp26a1O55127 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cyp26a1O55127 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cyp26a1O55127 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cyp26a1O55127 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cyp26a1O55127 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cyp26a1O55127 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cyp26a1O55127 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cyp26a1O55127 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Cyp26a1O55127 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Cyp26a1O55127 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cyp26a1O55127 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cyp26a1O55127 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cyp26a1O55127 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cyp26a1O55127 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cyp26a1O55127 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cyp26a1O55127 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cyp26a1O55127 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cyp26a1O55127 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cyp26a1O55127 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cyp26a1O55127 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cyp26a1O55127 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Cyp26a1O55127 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cyp26a1O55127 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cyp26a1O55127 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cyp26a1O55127 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Cyp26a1O55127 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cyp26a1O55127 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cyp26a1O55127 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cyp26a1O55127 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cyp26a1O55127 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cyp26a1O55127 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cyp26a1O55127 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cyp26a1O55127 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cyp26a1O55127 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cyp26a1O55127 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cyp26a1O55127 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Cyp26a1O55127 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cyp26a1O55127 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cyp26a1O55127 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cyp26a1O55127 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cyp26a1O55127 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cyp26a1O55127 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Cyp26a1O55127 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cyp26a1O55127 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cyp26a1O55127 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cyp26a1O55127 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cyp26a1O55127 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cyp26a1O55127 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cyp26a1O55127 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Cyp26a1O55127 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cyp26a1O55127 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cyp26a1O55127 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cyp26a1O55127 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Cyp26a1O55127 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cyp26a1O55127 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cyp26a1O55127 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cyp26a1O55127 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cyp26a1O55127 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cyp26a1O55127 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cyp26a1O55127 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cyp26a1O55127 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cyp26a1O55127 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cyp26a1O55127 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cyp26a1O55127 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cyp26a1O55127 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Cyp26a1O55127 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cyp26a1O55127 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Cyp26a1O55127 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cyp26a1O55127 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cyp26a1O55127 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cyp26a1O55127 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cyp26a1O55127 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cyp26a1O55127 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Cyp26a1O55127 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cyp26a1O55127 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cyp26a1O55127 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cyp26a1O55127 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cyp26a1O55127 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cyp26a1O55127 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cyp26a1O55127 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cyp26a1O55127 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Cyp26a1O55127 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cyp26a1O55127 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cyp26a1O55127 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cyp26a1O55127 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cyp26a1O55127 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cyp26a1O55127 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cyp26a1O55127 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Cyp26a1O55127 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Cyp26a1O55127 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms