Protein–RNA interactions for Protein: O55125

Nipsnap1, Protein NipSnap homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap1O55125 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nipsnap1O55125 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Nipsnap1O55125 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms