Protein–RNA interactions for Protein: O55017

Cacna1b, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, mousemouse

Predictions only

Length 2,327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1bO55017 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacna1bO55017 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cacna1bO55017 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna1bO55017 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna1bO55017 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna1bO55017 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna1bO55017 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna1bO55017 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna1bO55017 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna1bO55017 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna1bO55017 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna1bO55017 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna1bO55017 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna1bO55017 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna1bO55017 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cacna1bO55017 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna1bO55017 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna1bO55017 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna1bO55017 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna1bO55017 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna1bO55017 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna1bO55017 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna1bO55017 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna1bO55017 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna1bO55017 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna1bO55017 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna1bO55017 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna1bO55017 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna1bO55017 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna1bO55017 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna1bO55017 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna1bO55017 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna1bO55017 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna1bO55017 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna1bO55017 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna1bO55017 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna1bO55017 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna1bO55017 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna1bO55017 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna1bO55017 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cacna1bO55017 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Cacna1bO55017 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cacna1bO55017 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cacna1bO55017 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Cacna1bO55017 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cacna1bO55017 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Cacna1bO55017 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cacna1bO55017 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cacna1bO55017 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cacna1bO55017 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cacna1bO55017 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Cacna1bO55017 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cacna1bO55017 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Cacna1bO55017 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cacna1bO55017 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cacna1bO55017 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cacna1bO55017 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacna1bO55017 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacna1bO55017 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacna1bO55017 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacna1bO55017 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacna1bO55017 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacna1bO55017 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacna1bO55017 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacna1bO55017 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacna1bO55017 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacna1bO55017 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacna1bO55017 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacna1bO55017 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacna1bO55017 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cacna1bO55017 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacna1bO55017 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacna1bO55017 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacna1bO55017 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacna1bO55017 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacna1bO55017 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacna1bO55017 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacna1bO55017 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacna1bO55017 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cacna1bO55017 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacna1bO55017 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacna1bO55017 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacna1bO55017 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacna1bO55017 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacna1bO55017 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacna1bO55017 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacna1bO55017 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacna1bO55017 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacna1bO55017 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacna1bO55017 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacna1bO55017 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacna1bO55017 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacna1bO55017 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacna1bO55017 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cacna1bO55017 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cacna1bO55017 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cacna1bO55017 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Cacna1bO55017 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cacna1bO55017 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cacna1bO55017 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms