Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trappc3O55013 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trappc3O55013 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trappc3O55013 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trappc3O55013 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trappc3O55013 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trappc3O55013 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc3O55013 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc3O55013 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc3O55013 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc3O55013 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc3O55013 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc3O55013 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc3O55013 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc3O55013 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc3O55013 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trappc3O55013 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc3O55013 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc3O55013 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc3O55013 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc3O55013 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc3O55013 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc3O55013 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc3O55013 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc3O55013 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc3O55013 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc3O55013 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc3O55013 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc3O55013 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc3O55013 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc3O55013 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc3O55013 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc3O55013 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc3O55013 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trappc3O55013 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc3O55013 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc3O55013 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc3O55013 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc3O55013 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc3O55013 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc3O55013 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc3O55013 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc3O55013 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc3O55013 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc3O55013 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc3O55013 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trappc3O55013 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc3O55013 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc3O55013 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc3O55013 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc3O55013 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc3O55013 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc3O55013 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc3O55013 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc3O55013 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc3O55013 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc3O55013 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc3O55013 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trappc3O55013 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc3O55013 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc3O55013 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc3O55013 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc3O55013 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc3O55013 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc3O55013 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc3O55013 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trappc3O55013 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms