Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SlkO54988 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SlkO54988 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SlkO54988 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SlkO54988 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SlkO54988 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SlkO54988 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SlkO54988 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SlkO54988 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SlkO54988 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SlkO54988 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SlkO54988 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SlkO54988 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SlkO54988 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SlkO54988 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SlkO54988 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SlkO54988 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SlkO54988 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SlkO54988 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SlkO54988 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SlkO54988 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SlkO54988 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SlkO54988 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SlkO54988 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SlkO54988 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SlkO54988 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SlkO54988 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SlkO54988 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SlkO54988 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SlkO54988 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SlkO54988 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SlkO54988 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SlkO54988 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SlkO54988 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SlkO54988 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SlkO54988 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SlkO54988 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SlkO54988 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SlkO54988 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SlkO54988 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SlkO54988 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SlkO54988 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SlkO54988 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SlkO54988 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SlkO54988 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SlkO54988 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SlkO54988 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SlkO54988 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SlkO54988 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SlkO54988 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SlkO54988 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.96
SlkO54988 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
SlkO54988 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SlkO54988 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SlkO54988 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SlkO54988 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SlkO54988 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SlkO54988 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SlkO54988 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SlkO54988 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SlkO54988 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SlkO54988 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SlkO54988 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SlkO54988 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SlkO54988 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SlkO54988 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SlkO54988 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SlkO54988 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SlkO54988 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SlkO54988 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
SlkO54988 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
SlkO54988 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SlkO54988 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SlkO54988 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SlkO54988 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SlkO54988 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
SlkO54988 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SlkO54988 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
SlkO54988 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SlkO54988 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SlkO54988 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SlkO54988 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SlkO54988 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SlkO54988 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
SlkO54988 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SlkO54988 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SlkO54988 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SlkO54988 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
SlkO54988 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SlkO54988 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SlkO54988 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
SlkO54988 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SlkO54988 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SlkO54988 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SlkO54988 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SlkO54988 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SlkO54988 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
SlkO54988 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SlkO54988 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
SlkO54988 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms