Protein–RNA interactions for Protein: O54949

Nlk, Serine/threonine-protein kinase NLK, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NlkO54949 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NlkO54949 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NlkO54949 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NlkO54949 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NlkO54949 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NlkO54949 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NlkO54949 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
NlkO54949 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NlkO54949 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NlkO54949 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NlkO54949 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NlkO54949 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NlkO54949 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
NlkO54949 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
NlkO54949 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NlkO54949 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NlkO54949 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NlkO54949 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NlkO54949 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NlkO54949 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NlkO54949 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NlkO54949 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NlkO54949 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NlkO54949 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NlkO54949 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NlkO54949 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NlkO54949 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NlkO54949 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NlkO54949 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NlkO54949 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NlkO54949 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NlkO54949 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NlkO54949 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NlkO54949 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NlkO54949 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NlkO54949 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NlkO54949 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NlkO54949 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NlkO54949 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NlkO54949 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NlkO54949 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NlkO54949 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NlkO54949 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NlkO54949 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NlkO54949 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NlkO54949 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NlkO54949 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NlkO54949 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NlkO54949 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NlkO54949 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NlkO54949 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NlkO54949 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NlkO54949 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NlkO54949 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NlkO54949 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NlkO54949 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NlkO54949 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NlkO54949 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NlkO54949 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NlkO54949 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NlkO54949 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NlkO54949 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NlkO54949 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NlkO54949 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NlkO54949 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NlkO54949 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NlkO54949 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NlkO54949 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NlkO54949 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NlkO54949 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NlkO54949 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NlkO54949 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NlkO54949 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NlkO54949 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NlkO54949 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NlkO54949 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NlkO54949 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NlkO54949 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NlkO54949 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NlkO54949 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NlkO54949 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NlkO54949 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NlkO54949 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NlkO54949 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NlkO54949 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NlkO54949 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NlkO54949 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NlkO54949 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NlkO54949 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NlkO54949 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NlkO54949 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NlkO54949 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
NlkO54949 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NlkO54949 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NlkO54949 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NlkO54949 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NlkO54949 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NlkO54949 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NlkO54949 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NlkO54949 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms