Protein–RNA interactions for Protein: O54928

Socs5, Suppressor of cytokine signaling 5, mousemouse

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Socs5O54928 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Socs5O54928 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Socs5O54928 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Socs5O54928 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Socs5O54928 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Socs5O54928 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Socs5O54928 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Socs5O54928 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Socs5O54928 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Socs5O54928 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Socs5O54928 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Socs5O54928 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Socs5O54928 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Socs5O54928 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Socs5O54928 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Socs5O54928 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Socs5O54928 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Socs5O54928 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Socs5O54928 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Socs5O54928 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Socs5O54928 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Socs5O54928 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Socs5O54928 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Socs5O54928 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Socs5O54928 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Socs5O54928 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Socs5O54928 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Socs5O54928 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Socs5O54928 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Socs5O54928 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Socs5O54928 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Socs5O54928 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Socs5O54928 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Socs5O54928 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Socs5O54928 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Socs5O54928 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Socs5O54928 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Socs5O54928 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Socs5O54928 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Socs5O54928 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Socs5O54928 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Socs5O54928 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Socs5O54928 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Socs5O54928 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Socs5O54928 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Socs5O54928 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Socs5O54928 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Socs5O54928 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Socs5O54928 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Socs5O54928 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Socs5O54928 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Socs5O54928 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Socs5O54928 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Socs5O54928 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Socs5O54928 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Socs5O54928 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Socs5O54928 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Socs5O54928 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Socs5O54928 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Socs5O54928 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Socs5O54928 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Socs5O54928 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Socs5O54928 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Socs5O54928 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Socs5O54928 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Socs5O54928 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Socs5O54928 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Socs5O54928 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Socs5O54928 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Socs5O54928 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Socs5O54928 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Socs5O54928 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Socs5O54928 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Socs5O54928 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Socs5O54928 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Socs5O54928 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Socs5O54928 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Socs5O54928 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Socs5O54928 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Socs5O54928 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Socs5O54928 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Socs5O54928 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Socs5O54928 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Socs5O54928 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Socs5O54928 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Socs5O54928 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Socs5O54928 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Socs5O54928 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Socs5O54928 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Socs5O54928 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Socs5O54928 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Socs5O54928 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Socs5O54928 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Socs5O54928 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Socs5O54928 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Socs5O54928 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Socs5O54928 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Socs5O54928 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Socs5O54928 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Socs5O54928 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms