Protein–RNA interactions for Protein: O54909

Rdh16, Cis-retinol androgen dehydrogenase 1, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16O54909 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Rdh16O54909 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Rdh16O54909 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Rdh16O54909 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh16O54909 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Rdh16O54909 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Rdh16O54909 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Rdh16O54909 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdh16O54909 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdh16O54909 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdh16O54909 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdh16O54909 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Rdh16O54909 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Rdh16O54909 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rdh16O54909 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rdh16O54909 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rdh16O54909 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rdh16O54909 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rdh16O54909 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rdh16O54909 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Rdh16O54909 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Rdh16O54909 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
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Rdh16O54909 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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