Protein–RNA interactions for Protein: O54887

Tsks, Testis-specific serine kinase substrate, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TsksO54887 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TsksO54887 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TsksO54887 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TsksO54887 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TsksO54887 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TsksO54887 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TsksO54887 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TsksO54887 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TsksO54887 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TsksO54887 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TsksO54887 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TsksO54887 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TsksO54887 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TsksO54887 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TsksO54887 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TsksO54887 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TsksO54887 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TsksO54887 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TsksO54887 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
TsksO54887 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TsksO54887 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TsksO54887 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TsksO54887 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TsksO54887 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TsksO54887 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TsksO54887 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TsksO54887 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TsksO54887 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TsksO54887 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TsksO54887 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TsksO54887 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TsksO54887 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TsksO54887 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
TsksO54887 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TsksO54887 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TsksO54887 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TsksO54887 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TsksO54887 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TsksO54887 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
TsksO54887 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TsksO54887 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TsksO54887 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TsksO54887 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TsksO54887 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TsksO54887 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TsksO54887 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TsksO54887 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TsksO54887 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TsksO54887 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TsksO54887 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TsksO54887 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TsksO54887 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TsksO54887 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TsksO54887 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TsksO54887 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TsksO54887 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TsksO54887 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TsksO54887 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TsksO54887 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TsksO54887 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TsksO54887 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TsksO54887 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TsksO54887 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TsksO54887 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TsksO54887 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TsksO54887 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TsksO54887 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TsksO54887 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TsksO54887 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TsksO54887 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TsksO54887 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TsksO54887 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TsksO54887 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TsksO54887 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TsksO54887 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TsksO54887 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TsksO54887 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TsksO54887 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TsksO54887 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TsksO54887 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TsksO54887 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TsksO54887 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TsksO54887 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TsksO54887 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TsksO54887 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TsksO54887 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TsksO54887 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TsksO54887 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TsksO54887 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TsksO54887 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TsksO54887 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TsksO54887 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TsksO54887 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TsksO54887 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TsksO54887 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TsksO54887 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TsksO54887 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TsksO54887 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TsksO54887 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
TsksO54887 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms