Protein–RNA interactions for Protein: O54833

Csnk2a2, Casein kinase II subunit alpha', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk2a2O54833 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Csnk2a2O54833 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Csnk2a2O54833 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms