Protein–RNA interactions for Protein: O54785

Limk2, LIM domain kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limk2O54785 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Limk2O54785 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Limk2O54785 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Limk2O54785 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Limk2O54785 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Limk2O54785 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Limk2O54785 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Limk2O54785 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Limk2O54785 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Limk2O54785 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Limk2O54785 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Limk2O54785 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Limk2O54785 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Limk2O54785 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Limk2O54785 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Limk2O54785 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Limk2O54785 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Limk2O54785 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Limk2O54785 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Limk2O54785 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Limk2O54785 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Limk2O54785 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Limk2O54785 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Limk2O54785 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Limk2O54785 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Limk2O54785 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Limk2O54785 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Limk2O54785 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Limk2O54785 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Limk2O54785 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Limk2O54785 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Limk2O54785 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Limk2O54785 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Limk2O54785 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Limk2O54785 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Limk2O54785 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Limk2O54785 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Limk2O54785 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Limk2O54785 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Limk2O54785 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Limk2O54785 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Limk2O54785 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Limk2O54785 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Limk2O54785 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Limk2O54785 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Limk2O54785 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Limk2O54785 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Limk2O54785 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Limk2O54785 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Limk2O54785 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Limk2O54785 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Limk2O54785 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Limk2O54785 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Limk2O54785 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Limk2O54785 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Limk2O54785 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Limk2O54785 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Limk2O54785 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Limk2O54785 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Limk2O54785 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Limk2O54785 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Limk2O54785 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Limk2O54785 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Limk2O54785 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Limk2O54785 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Limk2O54785 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Limk2O54785 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Limk2O54785 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Limk2O54785 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Limk2O54785 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Limk2O54785 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Limk2O54785 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Limk2O54785 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Limk2O54785 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Limk2O54785 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Limk2O54785 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Limk2O54785 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Limk2O54785 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Limk2O54785 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Limk2O54785 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Limk2O54785 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Limk2O54785 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Limk2O54785 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Limk2O54785 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Limk2O54785 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Limk2O54785 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Limk2O54785 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Limk2O54785 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Limk2O54785 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Limk2O54785 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Limk2O54785 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Limk2O54785 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Limk2O54785 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Limk2O54785 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Limk2O54785 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Limk2O54785 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Limk2O54785 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Limk2O54785 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Limk2O54785 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Limk2O54785 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms