Protein–RNA interactions for Protein: O54781

Srpk2, SRSF protein kinase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 681 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srpk2O54781 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Srpk2O54781 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Srpk2O54781 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Srpk2O54781 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Srpk2O54781 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Srpk2O54781 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Srpk2O54781 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Srpk2O54781 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Srpk2O54781 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Srpk2O54781 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Srpk2O54781 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Srpk2O54781 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Srpk2O54781 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Srpk2O54781 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Srpk2O54781 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Srpk2O54781 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Srpk2O54781 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Srpk2O54781 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Srpk2O54781 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Srpk2O54781 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Srpk2O54781 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Srpk2O54781 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Srpk2O54781 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Srpk2O54781 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Srpk2O54781 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Srpk2O54781 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Srpk2O54781 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Srpk2O54781 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Srpk2O54781 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Srpk2O54781 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Srpk2O54781 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Srpk2O54781 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Srpk2O54781 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Srpk2O54781 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Srpk2O54781 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Srpk2O54781 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Srpk2O54781 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Srpk2O54781 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Srpk2O54781 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Srpk2O54781 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Srpk2O54781 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Srpk2O54781 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Srpk2O54781 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Srpk2O54781 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Srpk2O54781 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Srpk2O54781 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Srpk2O54781 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Srpk2O54781 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Srpk2O54781 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Srpk2O54781 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Srpk2O54781 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Srpk2O54781 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Srpk2O54781 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Srpk2O54781 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Srpk2O54781 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Srpk2O54781 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Srpk2O54781 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Srpk2O54781 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Srpk2O54781 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Srpk2O54781 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Srpk2O54781 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Srpk2O54781 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Srpk2O54781 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Srpk2O54781 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Srpk2O54781 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Srpk2O54781 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Srpk2O54781 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Srpk2O54781 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Srpk2O54781 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Srpk2O54781 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Srpk2O54781 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Srpk2O54781 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Srpk2O54781 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Srpk2O54781 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Srpk2O54781 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Srpk2O54781 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Srpk2O54781 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Srpk2O54781 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Srpk2O54781 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Srpk2O54781 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Srpk2O54781 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Srpk2O54781 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Srpk2O54781 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Srpk2O54781 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Srpk2O54781 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Srpk2O54781 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Srpk2O54781 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Srpk2O54781 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Srpk2O54781 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Srpk2O54781 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Srpk2O54781 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Srpk2O54781 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Srpk2O54781 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Srpk2O54781 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Srpk2O54781 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Srpk2O54781 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Srpk2O54781 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Srpk2O54781 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Srpk2O54781 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Srpk2O54781 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms