Protein–RNA interactions for Protein: O35906

Spib, Transcription factor Spi-B, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpibO35906 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
SpibO35906 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SpibO35906 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SpibO35906 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
SpibO35906 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
SpibO35906 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SpibO35906 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SpibO35906 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SpibO35906 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SpibO35906 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SpibO35906 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SpibO35906 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SpibO35906 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SpibO35906 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SpibO35906 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SpibO35906 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SpibO35906 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SpibO35906 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SpibO35906 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SpibO35906 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SpibO35906 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SpibO35906 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SpibO35906 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SpibO35906 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
SpibO35906 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SpibO35906 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SpibO35906 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SpibO35906 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SpibO35906 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SpibO35906 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SpibO35906 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SpibO35906 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SpibO35906 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SpibO35906 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SpibO35906 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SpibO35906 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SpibO35906 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SpibO35906 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SpibO35906 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SpibO35906 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SpibO35906 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SpibO35906 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SpibO35906 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SpibO35906 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SpibO35906 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SpibO35906 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SpibO35906 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SpibO35906 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SpibO35906 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SpibO35906 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SpibO35906 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SpibO35906 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SpibO35906 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SpibO35906 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SpibO35906 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SpibO35906 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SpibO35906 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SpibO35906 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SpibO35906 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SpibO35906 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SpibO35906 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SpibO35906 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SpibO35906 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SpibO35906 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SpibO35906 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SpibO35906 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SpibO35906 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SpibO35906 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SpibO35906 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SpibO35906 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SpibO35906 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SpibO35906 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SpibO35906 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SpibO35906 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SpibO35906 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SpibO35906 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SpibO35906 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SpibO35906 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SpibO35906 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SpibO35906 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SpibO35906 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SpibO35906 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SpibO35906 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SpibO35906 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SpibO35906 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SpibO35906 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SpibO35906 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SpibO35906 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SpibO35906 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SpibO35906 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SpibO35906 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SpibO35906 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SpibO35906 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SpibO35906 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SpibO35906 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SpibO35906 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SpibO35906 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SpibO35906 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SpibO35906 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
SpibO35906 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms