Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppfibp2O35711 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Ppfibp2O35711 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Ppfibp2O35711 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Ppfibp2O35711 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppfibp2O35711 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppfibp2O35711 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppfibp2O35711 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppfibp2O35711 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppfibp2O35711 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppfibp2O35711 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ppfibp2O35711 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppfibp2O35711 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppfibp2O35711 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppfibp2O35711 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppfibp2O35711 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppfibp2O35711 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppfibp2O35711 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppfibp2O35711 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppfibp2O35711 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppfibp2O35711 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppfibp2O35711 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppfibp2O35711 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Ppfibp2O35711 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppfibp2O35711 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppfibp2O35711 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppfibp2O35711 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppfibp2O35711 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppfibp2O35711 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppfibp2O35711 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppfibp2O35711 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppfibp2O35711 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ppfibp2O35711 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppfibp2O35711 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppfibp2O35711 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppfibp2O35711 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppfibp2O35711 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppfibp2O35711 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppfibp2O35711 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppfibp2O35711 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppfibp2O35711 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ppfibp2O35711 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppfibp2O35711 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppfibp2O35711 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppfibp2O35711 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppfibp2O35711 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppfibp2O35711 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppfibp2O35711 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppfibp2O35711 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppfibp2O35711 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ppfibp2O35711 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppfibp2O35711 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppfibp2O35711 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppfibp2O35711 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppfibp2O35711 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppfibp2O35711 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppfibp2O35711 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppfibp2O35711 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppfibp2O35711 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppfibp2O35711 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppfibp2O35711 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppfibp2O35711 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppfibp2O35711 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Ppfibp2O35711 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppfibp2O35711 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppfibp2O35711 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppfibp2O35711 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppfibp2O35711 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppfibp2O35711 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppfibp2O35711 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppfibp2O35711 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppfibp2O35711 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppfibp2O35711 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ppfibp2O35711 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ppfibp2O35711 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ppfibp2O35711 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Ppfibp2O35711 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ppfibp2O35711 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Ppfibp2O35711 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Ppfibp2O35711 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ppfibp2O35711 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ppfibp2O35711 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ppfibp2O35711 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Ppfibp2O35711 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppfibp2O35711 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppfibp2O35711 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppfibp2O35711 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppfibp2O35711 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppfibp2O35711 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppfibp2O35711 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppfibp2O35711 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppfibp2O35711 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppfibp2O35711 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ppfibp2O35711 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppfibp2O35711 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppfibp2O35711 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppfibp2O35711 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppfibp2O35711 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppfibp2O35711 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ppfibp2O35711 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms