Protein–RNA interactions for Protein: O35685

Nudc, Nuclear migration protein nudC, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NudcO35685 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NudcO35685 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NudcO35685 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NudcO35685 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NudcO35685 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NudcO35685 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NudcO35685 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NudcO35685 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NudcO35685 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NudcO35685 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NudcO35685 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NudcO35685 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NudcO35685 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NudcO35685 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NudcO35685 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NudcO35685 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NudcO35685 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NudcO35685 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NudcO35685 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NudcO35685 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NudcO35685 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NudcO35685 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NudcO35685 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NudcO35685 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NudcO35685 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NudcO35685 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NudcO35685 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NudcO35685 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NudcO35685 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NudcO35685 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NudcO35685 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NudcO35685 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NudcO35685 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NudcO35685 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NudcO35685 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NudcO35685 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NudcO35685 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NudcO35685 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NudcO35685 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NudcO35685 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NudcO35685 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NudcO35685 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NudcO35685 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NudcO35685 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NudcO35685 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NudcO35685 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NudcO35685 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NudcO35685 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NudcO35685 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NudcO35685 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NudcO35685 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NudcO35685 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NudcO35685 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NudcO35685 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NudcO35685 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NudcO35685 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
NudcO35685 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NudcO35685 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NudcO35685 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NudcO35685 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NudcO35685 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NudcO35685 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NudcO35685 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NudcO35685 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NudcO35685 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NudcO35685 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NudcO35685 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NudcO35685 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NudcO35685 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NudcO35685 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NudcO35685 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NudcO35685 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NudcO35685 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NudcO35685 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NudcO35685 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NudcO35685 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NudcO35685 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NudcO35685 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NudcO35685 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NudcO35685 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NudcO35685 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NudcO35685 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NudcO35685 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NudcO35685 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NudcO35685 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NudcO35685 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NudcO35685 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NudcO35685 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NudcO35685 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NudcO35685 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NudcO35685 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NudcO35685 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NudcO35685 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NudcO35685 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NudcO35685 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NudcO35685 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NudcO35685 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NudcO35685 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
NudcO35685 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NudcO35685 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms