Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sema6aO35464 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sema6aO35464 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sema6aO35464 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sema6aO35464 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sema6aO35464 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sema6aO35464 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sema6aO35464 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sema6aO35464 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sema6aO35464 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Sema6aO35464 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sema6aO35464 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sema6aO35464 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sema6aO35464 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sema6aO35464 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sema6aO35464 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sema6aO35464 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sema6aO35464 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sema6aO35464 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sema6aO35464 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Sema6aO35464 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sema6aO35464 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sema6aO35464 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sema6aO35464 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sema6aO35464 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sema6aO35464 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sema6aO35464 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sema6aO35464 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sema6aO35464 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sema6aO35464 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sema6aO35464 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sema6aO35464 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sema6aO35464 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sema6aO35464 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sema6aO35464 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sema6aO35464 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sema6aO35464 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sema6aO35464 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sema6aO35464 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sema6aO35464 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sema6aO35464 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sema6aO35464 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sema6aO35464 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Sema6aO35464 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sema6aO35464 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sema6aO35464 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sema6aO35464 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sema6aO35464 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sema6aO35464 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sema6aO35464 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sema6aO35464 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sema6aO35464 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sema6aO35464 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sema6aO35464 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sema6aO35464 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sema6aO35464 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sema6aO35464 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sema6aO35464 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sema6aO35464 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sema6aO35464 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sema6aO35464 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms