Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Foxd2O35392 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Foxd2O35392 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Foxd2O35392 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Foxd2O35392 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Foxd2O35392 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Foxd2O35392 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Foxd2O35392 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Foxd2O35392 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Foxd2O35392 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Foxd2O35392 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Foxd2O35392 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Foxd2O35392 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Foxd2O35392 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Foxd2O35392 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Foxd2O35392 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Foxd2O35392 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Foxd2O35392 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Foxd2O35392 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Foxd2O35392 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Foxd2O35392 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Foxd2O35392 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Foxd2O35392 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Foxd2O35392 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Foxd2O35392 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Foxd2O35392 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Foxd2O35392 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Foxd2O35392 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Foxd2O35392 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Foxd2O35392 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Foxd2O35392 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Foxd2O35392 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Foxd2O35392 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Foxd2O35392 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Foxd2O35392 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Foxd2O35392 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Foxd2O35392 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Foxd2O35392 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Foxd2O35392 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Foxd2O35392 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Foxd2O35392 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Foxd2O35392 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Foxd2O35392 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Foxd2O35392 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Foxd2O35392 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Foxd2O35392 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Foxd2O35392 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Foxd2O35392 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Foxd2O35392 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Foxd2O35392 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Foxd2O35392 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Foxd2O35392 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Foxd2O35392 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Foxd2O35392 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Foxd2O35392 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Foxd2O35392 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Foxd2O35392 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Foxd2O35392 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Foxd2O35392 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Foxd2O35392 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Foxd2O35392 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Foxd2O35392 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Foxd2O35392 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Foxd2O35392 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Foxd2O35392 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Foxd2O35392 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Foxd2O35392 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Foxd2O35392 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Foxd2O35392 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Foxd2O35392 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Foxd2O35392 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Foxd2O35392 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Foxd2O35392 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Foxd2O35392 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Foxd2O35392 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Foxd2O35392 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Foxd2O35392 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Foxd2O35392 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Foxd2O35392 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Foxd2O35392 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Foxd2O35392 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Foxd2O35392 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Foxd2O35392 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Foxd2O35392 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Foxd2O35392 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Foxd2O35392 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Foxd2O35392 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Foxd2O35392 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Foxd2O35392 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Foxd2O35392 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Foxd2O35392 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Foxd2O35392 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Foxd2O35392 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Foxd2O35392 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Foxd2O35392 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Foxd2O35392 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Foxd2O35392 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Foxd2O35392 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Foxd2O35392 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Foxd2O35392 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms