Protein–RNA interactions for Protein: O35367

Kera, Keratocan, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KeraO35367 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KeraO35367 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KeraO35367 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KeraO35367 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KeraO35367 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
KeraO35367 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KeraO35367 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KeraO35367 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KeraO35367 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KeraO35367 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KeraO35367 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KeraO35367 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KeraO35367 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KeraO35367 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KeraO35367 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
KeraO35367 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
KeraO35367 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KeraO35367 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KeraO35367 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KeraO35367 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KeraO35367 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KeraO35367 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KeraO35367 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KeraO35367 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KeraO35367 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KeraO35367 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KeraO35367 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
KeraO35367 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KeraO35367 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
KeraO35367 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KeraO35367 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KeraO35367 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KeraO35367 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KeraO35367 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
KeraO35367 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KeraO35367 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KeraO35367 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KeraO35367 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KeraO35367 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KeraO35367 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KeraO35367 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KeraO35367 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KeraO35367 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
KeraO35367 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KeraO35367 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KeraO35367 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KeraO35367 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
KeraO35367 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KeraO35367 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KeraO35367 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
KeraO35367 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KeraO35367 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KeraO35367 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KeraO35367 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KeraO35367 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KeraO35367 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KeraO35367 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
KeraO35367 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KeraO35367 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KeraO35367 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KeraO35367 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KeraO35367 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KeraO35367 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
KeraO35367 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KeraO35367 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KeraO35367 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
KeraO35367 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
KeraO35367 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KeraO35367 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KeraO35367 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KeraO35367 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KeraO35367 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KeraO35367 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KeraO35367 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KeraO35367 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KeraO35367 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KeraO35367 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KeraO35367 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KeraO35367 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KeraO35367 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KeraO35367 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KeraO35367 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KeraO35367 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KeraO35367 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KeraO35367 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
KeraO35367 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KeraO35367 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
KeraO35367 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KeraO35367 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KeraO35367 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KeraO35367 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KeraO35367 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KeraO35367 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KeraO35367 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KeraO35367 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
KeraO35367 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KeraO35367 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
KeraO35367 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KeraO35367 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
KeraO35367 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms