Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pkd2O35245 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pkd2O35245 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pkd2O35245 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pkd2O35245 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pkd2O35245 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Pkd2O35245 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pkd2O35245 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pkd2O35245 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Pkd2O35245 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Pkd2O35245 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pkd2O35245 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pkd2O35245 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pkd2O35245 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pkd2O35245 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Pkd2O35245 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pkd2O35245 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pkd2O35245 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pkd2O35245 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Pkd2O35245 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pkd2O35245 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pkd2O35245 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pkd2O35245 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pkd2O35245 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pkd2O35245 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pkd2O35245 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Pkd2O35245 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Pkd2O35245 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pkd2O35245 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Pkd2O35245 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pkd2O35245 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pkd2O35245 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pkd2O35245 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pkd2O35245 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Pkd2O35245 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pkd2O35245 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pkd2O35245 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pkd2O35245 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Pkd2O35245 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Pkd2O35245 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Pkd2O35245 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pkd2O35245 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pkd2O35245 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pkd2O35245 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pkd2O35245 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pkd2O35245 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pkd2O35245 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pkd2O35245 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pkd2O35245 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Pkd2O35245 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Pkd2O35245 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Pkd2O35245 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pkd2O35245 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Pkd2O35245 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Pkd2O35245 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Pkd2O35245 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Pkd2O35245 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Pkd2O35245 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pkd2O35245 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pkd2O35245 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pkd2O35245 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pkd2O35245 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pkd2O35245 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pkd2O35245 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pkd2O35245 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pkd2O35245 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Pkd2O35245 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pkd2O35245 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pkd2O35245 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pkd2O35245 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pkd2O35245 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Pkd2O35245 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pkd2O35245 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pkd2O35245 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Pkd2O35245 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pkd2O35245 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pkd2O35245 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pkd2O35245 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pkd2O35245 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Pkd2O35245 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pkd2O35245 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pkd2O35245 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pkd2O35245 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pkd2O35245 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Pkd2O35245 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pkd2O35245 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pkd2O35245 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pkd2O35245 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pkd2O35245 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Pkd2O35245 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pkd2O35245 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Pkd2O35245 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pkd2O35245 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pkd2O35245 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pkd2O35245 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pkd2O35245 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pkd2O35245 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pkd2O35245 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Pkd2O35245 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Pkd2O35245 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
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