Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Smad6O35182 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Smad6O35182 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Smad6O35182 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Smad6O35182 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smad6O35182 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smad6O35182 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Smad6O35182 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Smad6O35182 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smad6O35182 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Smad6O35182 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smad6O35182 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smad6O35182 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Smad6O35182 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smad6O35182 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smad6O35182 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smad6O35182 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smad6O35182 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Smad6O35182 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smad6O35182 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smad6O35182 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smad6O35182 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smad6O35182 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smad6O35182 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Smad6O35182 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smad6O35182 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smad6O35182 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smad6O35182 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smad6O35182 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Smad6O35182 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Smad6O35182 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smad6O35182 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smad6O35182 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smad6O35182 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smad6O35182 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Smad6O35182 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smad6O35182 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Smad6O35182 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smad6O35182 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Smad6O35182 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Smad6O35182 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smad6O35182 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Smad6O35182 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smad6O35182 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smad6O35182 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smad6O35182 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smad6O35182 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smad6O35182 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smad6O35182 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smad6O35182 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smad6O35182 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smad6O35182 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smad6O35182 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Smad6O35182 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Smad6O35182 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smad6O35182 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smad6O35182 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smad6O35182 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smad6O35182 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smad6O35182 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smad6O35182 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Smad6O35182 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smad6O35182 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smad6O35182 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smad6O35182 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Smad6O35182 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smad6O35182 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smad6O35182 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smad6O35182 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smad6O35182 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smad6O35182 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smad6O35182 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smad6O35182 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Smad6O35182 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smad6O35182 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smad6O35182 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smad6O35182 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smad6O35182 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Smad6O35182 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smad6O35182 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smad6O35182 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smad6O35182 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smad6O35182 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smad6O35182 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smad6O35182 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Smad6O35182 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Smad6O35182 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smad6O35182 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smad6O35182 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smad6O35182 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smad6O35182 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smad6O35182 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smad6O35182 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smad6O35182 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smad6O35182 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smad6O35182 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smad6O35182 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smad6O35182 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Smad6O35182 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Smad6O35182 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms