Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Kcns1O35173 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcns1O35173 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcns1O35173 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcns1O35173 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcns1O35173 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcns1O35173 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcns1O35173 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcns1O35173 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcns1O35173 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcns1O35173 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcns1O35173 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcns1O35173 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcns1O35173 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcns1O35173 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcns1O35173 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcns1O35173 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcns1O35173 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcns1O35173 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kcns1O35173 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcns1O35173 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcns1O35173 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcns1O35173 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcns1O35173 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcns1O35173 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcns1O35173 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcns1O35173 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcns1O35173 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcns1O35173 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcns1O35173 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcns1O35173 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcns1O35173 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcns1O35173 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcns1O35173 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcns1O35173 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcns1O35173 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcns1O35173 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kcns1O35173 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcns1O35173 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcns1O35173 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcns1O35173 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcns1O35173 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcns1O35173 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcns1O35173 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcns1O35173 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcns1O35173 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcns1O35173 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcns1O35173 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcns1O35173 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcns1O35173 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kcns1O35173 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcns1O35173 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcns1O35173 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcns1O35173 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcns1O35173 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcns1O35173 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcns1O35173 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcns1O35173 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcns1O35173 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcns1O35173 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcns1O35173 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcns1O35173 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcns1O35173 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcns1O35173 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcns1O35173 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kcns1O35173 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms