Protein–RNA interactions for Protein: O35111

Kcnk3, Potassium channel subfamily K member 3, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk3O35111 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Kcnk3O35111 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnk3O35111 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnk3O35111 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnk3O35111 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnk3O35111 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnk3O35111 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnk3O35111 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnk3O35111 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnk3O35111 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnk3O35111 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnk3O35111 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnk3O35111 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnk3O35111 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnk3O35111 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnk3O35111 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Kcnk3O35111 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnk3O35111 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnk3O35111 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnk3O35111 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnk3O35111 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnk3O35111 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnk3O35111 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnk3O35111 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnk3O35111 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnk3O35111 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnk3O35111 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnk3O35111 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnk3O35111 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Kcnk3O35111 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnk3O35111 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnk3O35111 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnk3O35111 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnk3O35111 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnk3O35111 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnk3O35111 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnk3O35111 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnk3O35111 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnk3O35111 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnk3O35111 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnk3O35111 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Kcnk3O35111 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnk3O35111 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnk3O35111 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Kcnk3O35111 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnk3O35111 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnk3O35111 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Kcnk3O35111 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Kcnk3O35111 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Kcnk3O35111 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
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Kcnk3O35111 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnk3O35111 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnk3O35111 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnk3O35111 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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Kcnk3O35111 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnk3O35111 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnk3O35111 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnk3O35111 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnk3O35111 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnk3O35111 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnk3O35111 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnk3O35111 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnk3O35111 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Kcnk3O35111 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnk3O35111 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnk3O35111 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnk3O35111 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnk3O35111 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnk3O35111 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnk3O35111 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnk3O35111 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnk3O35111 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnk3O35111 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Kcnk3O35111 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms