Protein–RNA interactions for Protein: O19443

H2-M10.1, Histocompatibility 2, M region locus 10.1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.1O19443 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2-M10.1O19443 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2-M10.1O19443 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
H2-M10.1O19443 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M10.1O19443 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M10.1O19443 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M10.1O19443 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M10.1O19443 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.08■□□□□ 0
H2-M10.1O19443 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M10.1O19443 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M10.1O19443 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M10.1O19443 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M10.1O19443 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M10.1O19443 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
H2-M10.1O19443 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-M10.1O19443 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-M10.1O19443 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-M10.1O19443 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-M10.1O19443 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-M10.1O19443 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-M10.1O19443 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H2-M10.1O19443 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-M10.1O19443 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-M10.1O19443 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.07■□□□□ 0
H2-M10.1O19443 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H2-M10.1O19443 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-M10.1O19443 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.07■□□□□ 0
H2-M10.1O19443 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.07■□□□□ 0
H2-M10.1O19443 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-M10.1O19443 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-M10.1O19443 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
H2-M10.1O19443 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-M10.1O19443 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-M10.1O19443 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
H2-M10.1O19443 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-M10.1O19443 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-M10.1O19443 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-M10.1O19443 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-M10.1O19443 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-M10.1O19443 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-M10.1O19443 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-M10.1O19443 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
H2-M10.1O19443 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
H2-M10.1O19443 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2-M10.1O19443 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2-M10.1O19443 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
H2-M10.1O19443 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2-M10.1O19443 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2-M10.1O19443 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2-M10.1O19443 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2-M10.1O19443 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2-M10.1O19443 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
H2-M10.1O19443 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
H2-M10.1O19443 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
H2-M10.1O19443 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-M10.1O19443 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.05■□□□□ -0
H2-M10.1O19443 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-M10.1O19443 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-M10.1O19443 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-M10.1O19443 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
H2-M10.1O19443 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-M10.1O19443 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.05■□□□□ -0
H2-M10.1O19443 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
H2-M10.1O19443 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-M10.1O19443 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-M10.1O19443 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-M10.1O19443 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-M10.1O19443 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
H2-M10.1O19443 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-M10.1O19443 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H2-M10.1O19443 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-M10.1O19443 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-M10.1O19443 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-M10.1O19443 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-M10.1O19443 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-M10.1O19443 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H2-M10.1O19443 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.04■□□□□ -0
H2-M10.1O19443 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-M10.1O19443 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
H2-M10.1O19443 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-M10.1O19443 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H2-M10.1O19443 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-M10.1O19443 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
H2-M10.1O19443 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC15.04■□□□□ -0
H2-M10.1O19443 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
H2-M10.1O19443 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
H2-M10.1O19443 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
H2-M10.1O19443 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-M10.1O19443 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-M10.1O19443 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-M10.1O19443 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-M10.1O19443 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-M10.1O19443 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
H2-M10.1O19443 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-M10.1O19443 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-M10.1O19443 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-M10.1O19443 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-M10.1O19443 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-M10.1O19443 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
H2-M10.1O19443 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms