Protein–RNA interactions for Protein: O08788

Dctn1, Dynactin subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn1O08788 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Dctn1O08788 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dctn1O08788 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dctn1O08788 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dctn1O08788 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Dctn1O08788 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dctn1O08788 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dctn1O08788 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dctn1O08788 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dctn1O08788 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Dctn1O08788 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Dctn1O08788 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Dctn1O08788 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Dctn1O08788 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dctn1O08788 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dctn1O08788 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dctn1O08788 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Dctn1O08788 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dctn1O08788 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dctn1O08788 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dctn1O08788 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dctn1O08788 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Dctn1O08788 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dctn1O08788 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dctn1O08788 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dctn1O08788 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dctn1O08788 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dctn1O08788 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dctn1O08788 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dctn1O08788 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dctn1O08788 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Dctn1O08788 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dctn1O08788 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dctn1O08788 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dctn1O08788 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dctn1O08788 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dctn1O08788 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dctn1O08788 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Dctn1O08788 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dctn1O08788 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dctn1O08788 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dctn1O08788 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dctn1O08788 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Dctn1O08788 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
Dctn1O08788 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dctn1O08788 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dctn1O08788 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dctn1O08788 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Dctn1O08788 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dctn1O08788 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dctn1O08788 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dctn1O08788 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dctn1O08788 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Dctn1O08788 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dctn1O08788 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dctn1O08788 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Dctn1O08788 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dctn1O08788 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dctn1O08788 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dctn1O08788 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dctn1O08788 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Dctn1O08788 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dctn1O08788 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dctn1O08788 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dctn1O08788 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dctn1O08788 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Dctn1O08788 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dctn1O08788 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dctn1O08788 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dctn1O08788 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dctn1O08788 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dctn1O08788 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dctn1O08788 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dctn1O08788 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dctn1O08788 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dctn1O08788 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dctn1O08788 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dctn1O08788 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Dctn1O08788 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Dctn1O08788 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Dctn1O08788 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dctn1O08788 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dctn1O08788 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dctn1O08788 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dctn1O08788 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dctn1O08788 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dctn1O08788 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Dctn1O08788 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dctn1O08788 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dctn1O08788 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dctn1O08788 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dctn1O08788 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dctn1O08788 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dctn1O08788 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dctn1O08788 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Dctn1O08788 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dctn1O08788 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dctn1O08788 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dctn1O08788 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Dctn1O08788 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms