Protein–RNA interactions for Protein: O08648

Map3k4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map3k4O08648 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Map3k4O08648 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Map3k4O08648 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Map3k4O08648 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Map3k4O08648 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Map3k4O08648 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Map3k4O08648 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Map3k4O08648 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Map3k4O08648 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
Map3k4O08648 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Map3k4O08648 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Map3k4O08648 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Map3k4O08648 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Map3k4O08648 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Map3k4O08648 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Map3k4O08648 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Map3k4O08648 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Map3k4O08648 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Map3k4O08648 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Map3k4O08648 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Map3k4O08648 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Map3k4O08648 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
Map3k4O08648 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Map3k4O08648 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Map3k4O08648 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Map3k4O08648 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Map3k4O08648 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Map3k4O08648 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Map3k4O08648 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Map3k4O08648 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Map3k4O08648 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Map3k4O08648 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Map3k4O08648 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Map3k4O08648 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Map3k4O08648 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Map3k4O08648 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Map3k4O08648 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Map3k4O08648 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Map3k4O08648 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Map3k4O08648 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Map3k4O08648 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Map3k4O08648 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Map3k4O08648 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Map3k4O08648 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Map3k4O08648 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Map3k4O08648 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Map3k4O08648 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Map3k4O08648 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Map3k4O08648 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Map3k4O08648 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Map3k4O08648 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Map3k4O08648 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Map3k4O08648 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Map3k4O08648 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Map3k4O08648 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Map3k4O08648 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Map3k4O08648 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Map3k4O08648 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Map3k4O08648 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Map3k4O08648 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Map3k4O08648 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Map3k4O08648 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Map3k4O08648 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Map3k4O08648 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Map3k4O08648 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Map3k4O08648 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Map3k4O08648 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Map3k4O08648 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Map3k4O08648 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Map3k4O08648 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Map3k4O08648 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Map3k4O08648 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Map3k4O08648 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Map3k4O08648 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Map3k4O08648 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Map3k4O08648 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Map3k4O08648 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Map3k4O08648 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Map3k4O08648 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Map3k4O08648 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Map3k4O08648 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Map3k4O08648 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Map3k4O08648 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Map3k4O08648 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Map3k4O08648 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Map3k4O08648 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Map3k4O08648 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Map3k4O08648 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Map3k4O08648 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Map3k4O08648 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Map3k4O08648 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Map3k4O08648 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Map3k4O08648 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Map3k4O08648 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Map3k4O08648 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Map3k4O08648 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Map3k4O08648 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Map3k4O08648 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Map3k4O08648 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Map3k4O08648 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms