Protein–RNA interactions for Protein: O08574

Mesp2, Mesoderm posterior protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp2O08574 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mesp2O08574 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mesp2O08574 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mesp2O08574 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mesp2O08574 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mesp2O08574 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mesp2O08574 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mesp2O08574 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mesp2O08574 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mesp2O08574 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mesp2O08574 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mesp2O08574 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mesp2O08574 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mesp2O08574 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mesp2O08574 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mesp2O08574 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mesp2O08574 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mesp2O08574 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mesp2O08574 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mesp2O08574 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mesp2O08574 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mesp2O08574 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mesp2O08574 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mesp2O08574 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mesp2O08574 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Mesp2O08574 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mesp2O08574 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mesp2O08574 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mesp2O08574 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mesp2O08574 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mesp2O08574 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mesp2O08574 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mesp2O08574 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mesp2O08574 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mesp2O08574 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Mesp2O08574 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mesp2O08574 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mesp2O08574 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mesp2O08574 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mesp2O08574 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mesp2O08574 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mesp2O08574 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Mesp2O08574 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mesp2O08574 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mesp2O08574 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mesp2O08574 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mesp2O08574 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mesp2O08574 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mesp2O08574 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mesp2O08574 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mesp2O08574 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Mesp2O08574 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mesp2O08574 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mesp2O08574 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mesp2O08574 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mesp2O08574 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mesp2O08574 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Mesp2O08574 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mesp2O08574 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mesp2O08574 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mesp2O08574 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mesp2O08574 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Mesp2O08574 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mesp2O08574 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mesp2O08574 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mesp2O08574 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mesp2O08574 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mesp2O08574 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mesp2O08574 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mesp2O08574 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Mesp2O08574 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mesp2O08574 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mesp2O08574 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mesp2O08574 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mesp2O08574 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mesp2O08574 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mesp2O08574 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mesp2O08574 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mesp2O08574 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mesp2O08574 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mesp2O08574 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mesp2O08574 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mesp2O08574 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mesp2O08574 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mesp2O08574 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Mesp2O08574 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Mesp2O08574 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mesp2O08574 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mesp2O08574 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mesp2O08574 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Mesp2O08574 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Mesp2O08574 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Mesp2O08574 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mesp2O08574 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mesp2O08574 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mesp2O08574 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mesp2O08574 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mesp2O08574 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mesp2O08574 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mesp2O08574 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms