Protein–RNA interactions for Protein: O08542

Efna4, Ephrin-A4, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna4O08542 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Efna4O08542 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efna4O08542 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efna4O08542 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efna4O08542 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efna4O08542 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efna4O08542 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efna4O08542 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efna4O08542 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efna4O08542 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efna4O08542 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efna4O08542 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efna4O08542 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efna4O08542 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efna4O08542 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efna4O08542 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Efna4O08542 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efna4O08542 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efna4O08542 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efna4O08542 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efna4O08542 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efna4O08542 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efna4O08542 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efna4O08542 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efna4O08542 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efna4O08542 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efna4O08542 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efna4O08542 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efna4O08542 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efna4O08542 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efna4O08542 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efna4O08542 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efna4O08542 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efna4O08542 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Efna4O08542 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efna4O08542 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efna4O08542 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efna4O08542 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efna4O08542 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efna4O08542 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Efna4O08542 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efna4O08542 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efna4O08542 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efna4O08542 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efna4O08542 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efna4O08542 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efna4O08542 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efna4O08542 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efna4O08542 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efna4O08542 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efna4O08542 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efna4O08542 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efna4O08542 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efna4O08542 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efna4O08542 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efna4O08542 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Efna4O08542 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efna4O08542 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efna4O08542 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efna4O08542 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efna4O08542 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efna4O08542 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efna4O08542 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efna4O08542 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efna4O08542 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efna4O08542 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efna4O08542 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efna4O08542 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Efna4O08542 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efna4O08542 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efna4O08542 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efna4O08542 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efna4O08542 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efna4O08542 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efna4O08542 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Efna4O08542 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efna4O08542 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efna4O08542 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efna4O08542 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efna4O08542 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efna4O08542 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Efna4O08542 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efna4O08542 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efna4O08542 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efna4O08542 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Efna4O08542 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efna4O08542 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efna4O08542 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efna4O08542 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efna4O08542 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efna4O08542 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efna4O08542 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efna4O08542 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efna4O08542 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efna4O08542 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efna4O08542 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efna4O08542 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efna4O08542 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efna4O08542 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Efna4O08542 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms